Konferenssi syntyi kylmän sodan aikana vuonna 1959 pitämään yhteyksiä erityisesti itä- ja länsieurooppalaisten kirkkojen kesken. Tavoitteeksi muodostui kirkkojen ykseyden edistäminen ja niiden yhteisen todistuksen vahvistaminen.

 

EKK pyrkii edistämään kirkkojen yhteyttä, rauhaa ja ihmisoikeuksia Euroopassa. Nykypäivän tärkeimpiä haasteita ovat esimerkiksi islamin asema Euroopassa, kehittyvän teknologian mukanaan tuomat eettiset kysymykset, naisiin kohdistuva väkivalta ja nuorten asema ekumeenisessa liikkeessä.

 

EKK:n jäsenkirkkoja Suomessa ovat luterilainen ja ortodoksinen kirkko. Yhteistyöelimenä toimii Suomen Ekumeeninen Neuvosto.

 

Suomen ortodoksisen kirkon edustajana EKK:n keskuskomiteassa on rovasti Rauno Pietarinen (v. 2012).